卡方檢定(Chi-Square test)：
主要適用於兩個類別或次序變數的差異分析，常用的以下四種：(1)適合度檢定(Goodness-of-fit test)、(2)同質性檢定、(3)獨立性檢定、(4)顯著性檢定，其中較常見的分析為獨立性檢定，其目的在考驗兩個類別變項是否相關？例如：運動與心血管疾病是否相關？
[程式]
>table1=table(exe,hd);table1 #.建立列聯表
>prop.table(table1,margin=1) #.檢視列比例(需注意方向性)
>prop.table(table1,margin=2) #.檢視行比例(需注意方向性)
>chisq.test(table1) #.卡方檢定
[結果]
[報表說明]
不運動(exe=1) 的人罹患心血管( hd=1)的百分比為46.3%，偶爾運動(exe=2) 的百分比為25.8%，經常運動 (exe=3) 的百分比為13.3%，經卡方檢結果，p值＜0.05，小於α=0.05的顯著水準，因此運動與是否發生血管疾病有關。
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